激光激发肯定比汞灯激发荧光强吗？

不一定，首先激光是单色光，如488nm，而汞灯下，有一定宽度的波长范围，如470-495nm， 激发波长不一样，得到图片的效果不一样；其次，激光下采集荧光用共聚焦模式，样品层切得比较薄，而汞灯下用CCD采集图片，样品层切得比较厚。因此看弱荧光，经常是激光不如汞灯下看得更好。

共聚焦拍照与普通荧光显微镜拍照有什么不同？

共聚焦用激光做光源，光电倍增管做检测器，逐点扫描，对应每个像素其能量比较高；汞灯虽然总功率高，但属于场照明，对应每个像素的能量并没有激光高。共聚焦有针孔，可以排除焦平面上焦点以外及非焦平面杂散光的影响，因此空间分辨率提高，但因为是每个像素每个像素逐点扫描，采集较慢，一张图并不是同一时间采集的，时间分辨率不高；CCD拍照取的是样品的同一时间。