生物显微镜与金相显微镜的区别主要是在照明方式与物镜上面：

    一、从物镜来看，生物显微镜的高倍物镜都有盖玻片厚度和载玻片、培养器皿厚度，所以其物镜通常标有/0.17、/1.2，这是为了校正玻璃对于光折射的影响，而金相显微镜的物镜通常标有/0。

    二、生物显微镜用的是透射照明，一般用来观察透明和半透明的样本，不能观察不透明物体。而金相显微镜主要是落射照明方式，光源从物镜射出，主要用于观察不透明样本的表面，也有附带透射照明装置的较金相显微镜，可同时用于观察透明样本。