倒置荧光显微镜的操作步骤如下：

      1. 准备调整

      (1) 遮蔽光线，关闭房间灯光，确保室内通风良好，无遮盖。之后将汞灯灯箱与荧光电源箱连接，再将荧光电源箱接通电源。

      (2) 打开电源开关确保汞灯工作稳定。

      2. 选择光路

      选择所需放大倍数的物镜，并将选择环置于相应的位置（1－PHL：4X；2－PHC：10X和20X；3－PH2：40X，4为明场；荧光选择钮置于BF）使用转动镜臂上的聚光镜旋钮使聚光镜移出光路，转动滤色片组转换手轮，将紫光（Ｖ）或蓝光（Ｂ）或绿光（Ｇ）激发滤色片组转入光路，并将10×荧光物镜转入光路。

      3. 进行调焦

      将标本放在载物台上，转动粗微调调节焦距使视野内图象清晰。再调整目镜，调整到眼睛观察舒适即可。

      4. 荧光观察    

      (1)将荧光染色标本放到载物台上。

      (2)将10×平场物镜或40×荧光物镜转入光路，调节载物台纵横移动手轮，将标本移入光路。

      (3)转动滤光片转换拨轮，将荧光染色标本所需要的激发滤光片组转入光路。激发滤光片组编号刻在滤片组转换拨轮上。

      滤光片选择正确与否，是荧光显微镜能否得到正确应用的关键。选择所需波段的荧光，并用荧光调节杆调节亮度.

      不观察时，要及时使用光栅切断荧光，避免样品荧光衰减  

      5. 荧光显微摄影--显微镜摄像头

      (1)由于荧光图像一般均较明场观察暗得多，所以进行荧光显微摄影需要较长的曝光时间，在曝光时应注意避免仪器震动。

      (2)荧光显微镜摄影技术对于记录荧光图像十分必要，由于荧光很易褪色减弱，要即时摄影记录结果。方法与普通显微摄影技术基本相同。因紫外光对荧光猝灭作用大。