理论上，没有一种光学系统能够产生理想的图像，因为各种像差的存在，包括五种基本单色像差以及色差，影响了生物显微镜的成像质量。 除了像差外，显微镜本身还存在一些因素，生物显微镜清晰度受多因素制约。 要点如下:

　　1)在使用生物显微镜时，所审查对象的比较标准很重要。如：切片厚度过厚，盖玻片是否符合国际标准..

　　2)生物显微镜，可以根据等级6-8换档中，最常用的平场消色差物镜被分成物镜。镜头档次太低，图像质量会下降。因此，建议选择上述等级水平目标的字段。

　　3)只有当聚光镜的孔径尽可能接近物镜的数值孔径时，才能获得最佳的成像分辨率。

　　4.生物显微镜清晰度受多因素制约，作为机械零件的重要组成部分，聚焦精度也十分重要..对于生物初学者或新接触生物显微镜的操作人员，熟练使用调焦系统，可以快速找到图像和调焦，提高工作效率。

　　5)在阶段部观察时，常做移动的X，Y轴。如：双机械移动站，更好的精度和稳定性，观察显微镜图像时可以提供良好的图像质量。

　　6)非球面聚光镜提供非常均匀的照明，与显微镜观察到的图像形成极好的对比度。

　　7)视场光柱应根据所观察到的不同物体和客观放大倍数，打开到合适的位置，如果图像的视场亮度过大或过小，不会受到影响。

　　8)所述的照明系统，低温，高色温的照明装置，观察到非常高的分辨率和显微图像的清晰度。

　　上述便是多方面影响清晰度的具体事项，若平常操作中可以避免，就能获得相对准确的试验结果。