LSCM 有着独特的激光扫描成像方式及精确的计算机测量定位系统，是普通显微镜和电子显微镜的飞跃和补充，加上高分辨率、高灵敏度和灵活性空间结构观察的独特优势，其成为生命科学、医学以及材料科学相关的诸多重要分支领域的全新科研实验手段和必备研究工具之一，为许多研究者提供了有力的技术支持和新的探索思路。目前该技术还存在着一些不足，扫描速度及光毒性程度与分辨率之间的矛盾，制约了活体细胞和组织荧光成像观测的范围;设备价格昂贵、对操作人员技术要求高，同样限制了该技术的应用。但研究人员相信，随着现代仪器及科学技术研究的飞速发展，加之诸多应用领域的迫切需求，LSCM 必然会不断改进和完善，在未来的科研工作中有着十分广阔的应用前景。