激光扫描共聚焦显微镜中各种样品串色的问题及其校正在图 5 中显示。图 5（ a）中的纤维原细胞， Alexa Fluor488 绿色荧光串色进入 Mito Tracker 红色通道，当样品用 488 激光和 543 激光同时扫描时，会产生黄色的肌动蛋白丝。序列扫描和检测（图 5d）消除了串色影响。同样地，在用 Cy3 和核探针 DRAQ5 对老鼠大肠厚切片进行同时扫描时（图 5b），也会发生串色。序列扫描可以去掉串色假象（图 5e），而串色假象会造成虚假的共定位。