共聚焦显微镜的优势：

1、高分辨率

16bit。由于是激光和荧光的共聚焦成像以及Pinhole的应用阻止了焦点以外的干扰衍射光和散射光，共聚焦显微镜的分辨率远非普通荧光显微镜所能及，这也是国际上共聚焦显微镜大为流行的原因之一。

2、断层扫描

共聚焦采取电动马达自动控制步距，使得Z轴上的最小移动步距可精确到40nm。这使得在Z轴上成像的XZt、YZt的操作变得简单易行。而且断层扫描的优势明白人一想就会发现其中的优势所在！

3、共扼显像

多通道采集图像的功能很方便地使共聚焦具有同时获取不同光谱段的荧光信号的功能。并通过软件处理得到层叠效应图像。并且通过补偿设置可以消除不同荧光信号之间的Cross talk带来的影响。

4、微分干涉成像

倍增样本源光谱的立体视觉和微弱信号的差异，使图像清晰地显示不同的差异表达。

5、三维重建

正因为共聚焦的高分辨率和高清晰度为其进行三维重建提供了不可多得的优势。重建后的动画来源于真实的生理学原件、展现的是生命奥秘最初始的动态现象，而不是电脑制作的纯欣赏意义上的医学动画！！！这不是一般的显微镜能够替代的。

6、荧光的半定量和绝对定量

荧光有强有弱，能够提供一个确切的数值来量化荧光表达的强弱无疑对研究者来说是一件非常快慰的事，不是吗？尤其近两年发展起来的内参法绝对定量，使得国际科研界再一次掀起共聚焦热潮。

7、动态研究

SCIENCE2003第4期有三分之一的文章是序列讲述共聚焦相关的文献。谈得最多的就是动态的共聚焦应用。有兴趣吗？

普通荧光显微镜（fluoroscence）的优势：

1、操作相对较简便。

2、使用费用相对较低。

3、仪器相对较普及。