自从显微镜发明以后，就不断被改进。就物理学的进步，也为显微镜带来了更新。到现在为止，显微镜的构造与技术已大有改善。根据显微镜的结构和所使用的媒介，显微镜大致上可分为以下数种。   

（1）光学显微镜（Opticalmicroscope）光学显微镜以可见光作观察媒介，用肉眼作观察的工具。

（A）根据它们的构造，光学显微镜又可以被分成以下两种。（a）单式显微镜（simplemicroscope）,单式显微镜是由简单的凸透镜组合而成。由于它的镜片都是简单的凸透镜，所以放大率与解像力都较弱。（b） 複式显微镜（compoundmicroscope）,複式显微镜的镜片都是球面镜的组合，所以色差与球面像差都较小，成像较为清晰。是zui普遍使用的显微镜。

 （B）根据显微镜的构造，显微镜又可以被分成以下两种。

（a）单筒式显微镜（monocularmicroscope）,单筒式显微镜只有一支镜筒，需要使用一只眼睛进行观察，一般用来观察平面影像。大部份学校使用的显微镜都属这一类。同学在使用时，宜用左眼透过显微镜进行观察样本，右眼同时留意自己所绘的图样，以确保所绘者类似样本。（b）双筒式显微镜（binocularmicroscope）,双筒式显微镜有两支镜筒，需要使用两只眼睛同时进行观察。一般用来观察立体影像时用。如解剖显微镜（dissectingmicroscopes）等。  

（2）紫外线显微镜（ultra-violetmicroscope）,由于所使用的光波波长愈短，显微镜的解释力（resolvingpower）就愈大。紫外线的波长较可见光更短，所以解像力就更高。所以紫外线显微镜适用于观察细菌等微小的生物。但人眼不能见到紫外线，所以影像都会透过萤光幕输出。   

（3）电子显微镜（electronicmicroscopes）,电子显微镜以电子束作扫瞄媒介。由于电子束的波长很短，所以电子显微镜的解像度很高。但电子显微镜的电子束只可以在真空中运行，所以标本也需要放在真空中才可以进行观察，影像也会透过萤光幕输出。下图为一座电子显微镜的图片。    随着科学进步，电子显微镜已发展到可以扫瞄立体影像，称为扫瞄电子显微镜（scanningelectronmicroscope）。电子显微镜的体积也日益缩小，并应用在立体透视显影。使医学的诊断工作更容易进行。